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家蚕27、28号染色体基因的生物信息学分析
家蚕27、28号染色体基因的生物信息学分析
Bioinformatic Analysis of Genes on Chromosomes 27 and 28 in Bombyx mori
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<<蚕业科学>>2009年 第35卷 第02期
作者: 段彪, 查幸福, 沈以红, 代方银, 夏庆友, 向仲怀,
期刊-核心期刊 ISSN : 0257-4799(2009)02-0241-07
利用家蚕基因组精细图分析第27、28号染色体上的基因结构及其编码蛋白的功能结构域,可为在家蚕资源库中鉴定这两条染色体上的突变基因以及发现新的形态标记提供重要线索.基因预测及结构分析显示:家蚕第27和28号染色体是基因数目最少的两条染色体,预测基因数目分别是241个和288个,平均每个基因分别具有7.7和5.3个外显子;蛋白质全长编码区序列(CDS)长度主要分布于400-800 bp之间;CDS的GC含量分别是49.72%和46.54%.蛋白质功能结构域分析发现,家蚕第27、28号染色体上基因所编码的蛋白分别具有76和92种结构域,其中最多的3种结构域分别为Sugar_tr、MFs_1、zf-C2H2和UDPGT、DUF、Serpin.将家蚕第27、28号染色体上的预测基因与果蝇突变基因进行同源检索的结果显示,家蚕第27、28号染色体上分别有16和15个基因具有明显的可能突变表型.
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一种新的家蚕体形突变体——短体蚕(Sq)的遗传分析与基因定位 Genetic analysis and gene localization of a new body shape mutant,Squab (Sq),in the silkworm,Bombyx mori 作者:代方银,童晓玲,谭端,黄永燕,罗尤海,鲁成,向仲怀, 期刊-核心期刊 昆虫学报ACTA ENTOMOLOGICA SINICA 2009年 第05期 |
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